Khi nói đến hiện tượng cận huyết hay loạn luân là nói đến những vấn đề nhạy cảm, phức tạp vì liên quan đến đời sống xã hội và pháp luật.
Những nghi vấn xung quanh vấn đề cận huyết hay loạn luân ở Tịnh Thất Bồng Lai khi nhìn dưới góc độ khoa học tiềm ẩn nguy cơ đột biến gen, gây ảnh hưởng đến sự phát triển thể chất và trí tuệ con người.
Sau buổi livestream của bà Nguyễn Phương Hằng về Tịnh Thất Bồng Lai, những vấn đề này lại càng nóng hơn với sự xuất hiện của người tự xưng là con trai ông Lê Tùng Vân tên Lê Thanh Minh Tùng. Theo tố cáo của anh này, ở Tịnh Thất Bồng Lai - Thiền Am Bên Bờ Vũ Trụ đã và đang xảy ra những mối quan hệ cận huyết.
Hiện nay, chính quyền địa phương nơi sở tại đã đưa ra những bằng chứng xác minh về việc Tịnh Thất Bồng Lai - Thiền Am Bên Bờ Vũ Trụ vi phạm pháp luật trong việc lợi dụng Phật giáo và danh nghĩa nuôi trẻ mồ côi nhằm trục lợi cá nhân. Tuy nhiên những nghi vấn khác quanh câu chuyện về địa điểm này hiện vẫn chưa có chứng cứ xác thực.
Tuy vậy, những thông tin về loạn luân, cận huyết tại Tịnh thât bồng lai lại đang dấy lên một sự hoang mang lo ngại tới tâm lý và cuộc sống người dân xung quanh.